Bis vor kurzem dachte man, dass der Grund für die Rotfärbung des Lago di Tovel vielleicht eine Alge (Glenodinium sanguineum) sei.
Das Plasma dieser Alge enthält fettlösliche, farbige Pigmente (Carotenoidi). Wenn sie im Sommer an die Oberfläche steigt, soll sie den See rot färben. Seit 1964 ist dieses Phänomen nicht mehr aufgetaucht. Eventuell ist die geringere Zahl an Kühen auf den Almen der Grund. Tatsächlich wurden durch die Hinterlassenschaften der Kühe Nährstoffe eingeleitet, die die Algen ernährten.
Kürzlich hat das Istituto Agrario di S. Michele all'Adige entdeckt, dass die Rotfärbung des Lago di Tovel nicht dem Glenodinium zugerechnet werden sollte, sondern anderen drei Algenarten. Da wäre zunächst die Tovellia sanguinea (eine „rote“ Art, die heute wegen der geringen Nährstoffmenge nur minimal vorkommt); die Baldinia anauniensis (eine „grüne“ Art, die jetzt sehr häufig vorkommt und die heute typische Farbe verursacht) und eine dritte Alge, deren Art derzeit erforscht wird.
